Assim como tinha feito com a Princesa Isabel e com o Conde d´Eu, a elite cafeicultora paulista articula um golpe contra Deodoro. Rei morto, rei posto, rei morto novamente. Diante das fortes pressões que recebe e da falta de apoio, Deodoro renuncia em 23 de novembro de 1891. Nesse dia, diante das circunstâncias, deve ter-se arrependido de conspirar contra D. Pedro II. Entre as principais causas da queda de Deodoro estão justamente “as dissensões surgidas em torno da aprovação de algumas medidas fundamentais à ordem federativa, dificultada pelo presidente da República”.
Como se pode ver, tudo que se interpusesse entre a elite paulista e seu projeto de poder era imediatamente alijado, eliminado. Floriano governaria até 1894, quando então passa o poder para os paulistas em 15 de novembro de 1894, poder da elite cafeeira paulista fecha um ciclo que havia começado em 1870 com o Manifesto Republicano.
Entre 1894 e 1930, essa elite vai se apoderar do Estado brasileiro e elevar até a última potência seu aparelhamento. O intervencionismo e o protecionismo estatal e um setor da cadeia produtiva era o que havia de mais retrógrado e conservador num mundo onde o liberalismo econômico e político viviam o auge. O Brasil tornou-se assim uma espécie de ornitorrinco, um ser sem forma definida.
O principal alvo dos republicanos após a Proclamação da República será o Marechal Deodoro. Todos sabiam que ele era mais monarquista que o imperador deposto. Na verdade, ele havia sido útil como elemento aglutinador das Forças Armadas na articulação do golpe contra a Monarquia. Efetivado o golpe, passava ele a ser o elemento a se extirpar. A menina dos olhos dos republicanos era o federalismo, que, na cabeça deles, seria mais um separatismo do que uma união das províncias transformados em estados. A autonomia que os estados teriam e a possibilidade de eleger governadores – na Monarquia, eles eram indicados pelo imperador – constituíam o cerne do desejo dos republicanos. O federalismo foi, antes, uma forma que o estado de São Paulo, sobretudo, encontrou de se livrar do Brasil.